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Un arbre représentant la généalogie sous le p-coalescent. En bleu, les arbres minimaux contenant respectivement { g1 , g2 } et { g3 , g5 }. [Renaud Alie]. |
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La table de vérité pour le calcul d'une coalescence stricte. Le calcul de l'ensemble A1+2 correspond à un et logique sur les séquences A d'origine. On peut voir aussi la correspondance symbolique utilisée pour représenter l'encodage binaire. [Éric Marcotte]. |
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Illustration schématique des résultats de DMap avec 5 proportions différentes de données manquantes. L'échantillon est généré selon le scénario B2. [Na Yang]. |
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Surface de vraisemblance de la position conjointe de deux gènes en interaction influençant un caractère génétique. [Myriam Ziou]. |
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Le pirate (carré noir), qui a une vue limitée à une case autour de lui, cherche à attraper le matelot (carré bleu). Le matelot, lui, cherche à aller vers un des deux trésors (carrés jaunes). À chaque déplacement, le pirate se déplace en fonction des probabilités estimées de la position du matelot; les teintes rouges des cases sont proportionnelles à la probabilité estimée que le matelot se trouve dans cette case. Ces probabilités sont estimées à l'aide d'un modèle de semi-Markov caché, avec apprentissage [Cédric Beaulac]. |
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La recherche consiste à estimer l'histoire de la taille de la population à partir de la généalogie de celle ci, généalogie qui est construite à partir des séquences d'ADN. [Sadoune Ait Kaci Azzou]. |
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| La formule 4.14 est centrale dans les résultats du mémoire; il s'agit de la probabilité d'haplotypes porteurs et non porteurs conditionnellement au génotype, au phénotype et aux distributions des haplotypes porteurs et non porteurs dans la population. [Gabrielle Boucher] |
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| Série d'évènements de coalescence, de recombinaison et de mutation qui relient un échantilllon de séquences à leur ancêtre commun, [Hugues Massé] |
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| Surface de vraisemblance de la position simultanée de deux mutations influençant un caractère; les lignes pointillées rouges indiquent la position cherchée, [Marie Forest] |
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| Description de la stratégie permettant de "lacher" des mutations sur des branches d'arbres afin d'estimer la position d'une mutation influençant un caractère, [Marie-Hélène Descary] |
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| Ces figures illustrent l'effet de l'augmentation des risques du modèle génétique (par les RR, Risques Relatifs), sur l'estimation des allèles mutants créant une maladie. L'axes des abcisses correspond à une coordonée le long d'une séquence d'ADN, et l'axe des ordonnées correspond à des taux de succès. Chaque courbe de couleur différente illustre un taux de succès d'estimation des allèles mutants parmi les cas, contrôles, porteurs et non porteurs. On peut voir que l'estimation s'améliore autour de la position réelle de la mutation causant la maladie (trait vertical rouge), [Mathieu Dupont] |
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| Exemple de vraisemblance en ajustant pour la pénétrance incomplète; l'axe des abcisses correspond à une coordonnée le long d'une séquence génétique, et l'axe des ordonnées coorespond au logarithme de la vraisemblance. Les données sont des données réelles de patients atteints de Fibrose Kystique; la ligne pointillée verticale rouge indique la position réelle (connue dans ce cas) de la principale mutation caussant la maladie. [Sarah Vahey] |
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| Relation entre différentes caractéristiques de cellules provenant de patients potentiellement cancéreux; l'objectif est de déterminer quelles caractéristiques sur les cellules permettent de distinguer des groupes de patients; les caractéridtiques des cellules sont obtbues par cytométrie par flux, [Oscar Ortiz] |
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